现代高效液相色谱中，分离效果好坏很大程度上取决于色谱填料的选择。但是色谱填料的选择范围很宽，要做合适的选择，必须对此有一定的认识和了解。

　　1，正相色谱

　　正相色谱用的固定相通常为硅胶（Silica），以及其他具有极性官能团，如胺基团 （NH2，APS）和氰基团（CN，CPS）的键合相填料。

　　由于硅胶表面的硅羟基（SiOH）或其他团的极性较强，因此，分离的次序是依据样品 中的各组份的极性大小，即极性强弱的组份最先被冲洗出色谱柱。 正相色谱使用的流动相极性相对比固定相低，如：正乙烷（Hexane），氯仿（Chloroform），二氯甲烷（Methylene Chloride）等。

　　2，反相色谱

　　反相色谱填料常是以硅胶为基础，表面键合有极性相对较弱的官能团的键合相。 反相色谱所使用的流动相极性较强，通常为水，缓冲液与甲醇，已腈等混合物。 样品流出色谱柱的顺序是极性较强组合最先被冲出，而极性弱的组份会在色谱柱上有 更强的保留。 常用的反相填料有C18（ODS），C8（MOS），C4（B），C6H5（Phenyl）等。